TRPチャネル作動剤・阻害剤：医薬品分子モデリング勉強会

医薬品分子モデリング勉強会：TRPチャネル作動剤・拮抗阻害剤

　TRPチャネルの作動剤（アゴニスト、agonist）と拮抗阻害剤（アンタゴニスト、antagonist）の安定コンホメーション（三次元構造）と静電ポテンシャル分布を見ておく。
　演習では、MMFFの最初の一分子から形式的に比較。

カプサイシン（Capsaicin）
- B3LYP 6-31G＊（＝6-31G(d)）計算結果。
  
  　Max(静電ポテンシャル)：202.599711 (kJ/mol)
  　Min(静電ポテンシャル)：-188.165578 (kJ/mol)
  　Surf Area：361.61 (Å²)
  　【三次元モデル（PDF）】
  　カプサイシン（Capsaicin）・棒球　／　カプサイシン（Capsaicin）・CPK
- B3LYP 6-311+G＊＊（＝6-311+G(d,p)）計算結果。
  
  　Max(静電ポテンシャル)：211.958582 (kJ/mol)
  　Min(静電ポテンシャル)：-193.693644 (kJ/mol)
  　Surf Area：374.40 (Å²)
  　【三次元モデル（PDF）】
  　カプサイシン（Capsaicin）・棒球　／　カプサイシン（Capsaicin）・CPK
カプサゼピン・構造異性体（Capsazepine Isomer）
　※7,8-ジヒドロキシ体の筈が、6,7-ジヒドロキシ体であることが判明。数年前の計算結果なので、一緒に掲載。
- B3LYP 6-31G＊（＝6-31G(d)）計算結果。
  
  　Max(静電ポテンシャル)：206.65628 (kJ/mol)
  　Min(静電ポテンシャル)：-173.067815 (kJ/mol)
  　Surf Area：350.85 (Å²)
  　【三次元モデル（PDF）】
  　カプサゼピン・構造異性体（Capsazepine Isomer）・棒球　／　カプサゼピン・構造異性体（Capsazepine Isomer）・CPK
- B3LYP 6-311+G＊＊（＝6-311+G(d,p)）計算結果。
  
  　Max(静電ポテンシャル)：217.737614 (kJ/mol)
  　Min(静電ポテンシャル)：-160.547098 (kJ/mol)
  　Surf Area：352.99 (Å²)
  　【三次元モデル（PDF）】
  　カプサゼピン・構造異性体（Capsazepine Isomer）・棒球　／　カプサゼピン・構造異性体（Capsazepine Isomer）・CPK
カプサゼピン（Capsazepine）
　Pending...
ヨードレシニフェラトキシン（Iodoresiniferatoxin）
- B3LYP 6-31G＊（＝6-31G(d)）計算結果。
  ※空きリソースで細々とする限り、『6-31G＊』計算だけで年単位の時間を要するため、＋25 kJ/mol（6 kcal/mol）目安で切り上げ＆『6-311+G＊＊』は棚上げ。
  
  　Max(静電ポテンシャル)：219.50724 (kJ/mol)
  　Min(静電ポテンシャル)：-169.897623 (kJ/mol)
  　Surf Area：586.10 (Å²)
  　【三次元モデル（PDF）】
  　ヨードレシニフェラトキシン（Iodoresiniferatoxin）・棒球　／　ヨードレシニフェラトキシン（Iodoresiniferatoxin）・CPK

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